La Secretaria Ejecutiva de Administración y Finanzas, esta conformada por los siguientes departamentos:
- Departamento de Bienes Nacionales
- Dirección de Servicios Generales
- Departamento de Transporte
- Librería Universitaria
- Dirección de Adquisiciones
- Departamento de Gestión y Cobros
- Dirección de Contaduría
- Dirección de Finanzas y Presupuesto
- Dirección de Tesorería